Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Gm20918J3QN17 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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