Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn34c3J3QJW5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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