Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6882J3KMT3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms