Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21818J3KMS6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms