Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3tc1G3X9F6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3tc1G3X9F6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms