Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm20518E9Q548 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm20518E9Q548 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm20518E9Q548 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm20518E9Q548 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm20518E9Q548 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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