Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms