Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms