Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gcn1E9PVA8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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