Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb3D3Z6J4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms