Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc6D3YZP9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms