Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6685D3YYP3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6685D3YYP3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms