Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vsig10D3YX43 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms