Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfap70D3YVL2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap70D3YVL2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms