Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syce3B5KM66 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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