Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clrn2B2RVW2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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