Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms