Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usf3B2RUQ2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms