Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms