Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rrn3B2RS91 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rrn3B2RS91 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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