Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp42B2RQC2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp42B2RQC2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp42B2RQC2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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