Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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