Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms