Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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