Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms