Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd2V9GX34 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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