Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm26992S4R1A3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm26992S4R1A3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm26992S4R1A3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm26992S4R1A3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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