Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgr5Q9Z1P4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms