Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Skp2Q9Z0Z3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms