Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psma1Q9R1P4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms