Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psma4Q9R1P0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms