Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Gpc1Q9QZF2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc1Q9QZF2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms