Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ercc4Q9QZD4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ercc4Q9QZD4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms