Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms