Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Dkk3Q9QUN9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dkk3Q9QUN9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms