Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms