Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cabp1Q9JLK7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cabp1Q9JLK7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms