Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Nectin3Q9JLB9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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