Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb3Q9JKS4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms