Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Chrac1Q9JKP8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Chrac1Q9JKP8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Chrac1Q9JKP8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Chrac1Q9JKP8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Chrac1Q9JKP8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Chrac1Q9JKP8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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