Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl28Q9JIL2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl28Q9JIL2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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