Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Rb1cc1Q9ESK9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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