Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms