Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Bap18Q9DCT6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Bap18Q9DCT6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms