Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrpraQ9DBG7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms