Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pdzd9Q9D9M4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzd9Q9D9M4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd9Q9D9M4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms