Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx5Q9D8U8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms