Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ifi35Q9D8C4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms