Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms