Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms